במהלך פעילות של כוחות צה"ל בשכם נרשמו עימותים אלימים עם פלסטינים במקום. באחת התקריות, ילד השליך אבנים על כוחות צה"ל ובתגובה הם כיוונו אליו ירי שפצע אותו והוא פונה להמשך טיפול במרכז רפואי בעיר.
כמו כן, לאחר שתושבי המקום גילו כי כוחות צה"ל נמצאים בשטח, החלו כמה מהם להשליך לעבר הכוחות בקבוקי ירי וליידות אבנים, הלוחמים הגיבו באש וזוהו מספר פגיעות. לא היו נפגעים, בחסדי שמים, בקרב כוחותינו.
