למרות שהמבצע הוצג לציבור כפעולה אשר זכתה לתמיכה רחבה, במהלך הדיונים טרם ביצועו נשמעו גם קולות מתנגדים והסתייגויות שונות. על פי מקורות המקורבים לפרטי הדיונים, אחת ההסתייגויות הבולטות ביותר הגיעה מראש המוסד דדי ברנע, שהתייחס הן לתזמון והן למיקום התקיפה. כך דווח ב'חדשות 12'.
לדברי המקורות, ראש המוסד אמר: "עד היום, מי שהצליח בסוף להשפיע על עסקה היו הקטרים. קחו את זה בחשבון. מן הסתם, כולם בני מוות ביום שאחרי המלחמה. אבל כל עוד הם שם, כמתווכים המרכזיים, לדעתי זו טעות." בנוסף, נשמע טיעון נוסף שהתקיפה עלולה לפגוע קשות באמון שמוסד ישראלי טווה עם קטאר, ואף להשפיע על האמון מול מדינות אחרות.
על פי המקורות, ברנע אף הציע לדחות את המבצע כשבוע ימים: "עד אחרי שיפוג האולטימטום של טראמפ לחמאס להשיב להצעה באופן רשמי."
עוד באתר:
למרות פניית 'חדשות 12' לדוברות המוסד, שם סירבו להתייחס לפרסום. עם זאת, נמסר כי גם ראש אמ"ן בינדר, הרמטכ"ל אייל זמיר והאלוף ניצן אלון, שכפי שפורסם אמש לא הוזמנו לדיונים המרכזיים, חלקו את הדעה ש"לא בהכרח תהיה השפעה חיובית על המו"מ, וצריך למצות את נתיב המו"מ עוד לפני ביצוע ניסיון החיסול."
העדות הזאת מעלה כי לא כל הגורמים הבכירים תמכו במבצע באופן מלא, ושיקולי תזמון, מיקום והשפעה על יחסי האמון נלקחו בחשבון בחדרי הדיונים.
